67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3199 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  56.38 
 
 
95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  53.76 
 
 
96 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  53.76 
 
 
96 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  54.74 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  54.26 
 
 
104 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  55.21 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 
97 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  40.23 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 
98 aa  66.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  37.08 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  32.61 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  35.23 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  38.2 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  36.36 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.48 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  35.23 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  38.16 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.12 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  30.77 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  50.91 
 
 
60 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  32.61 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  34.07 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  29.79 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 
99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  34.09 
 
 
100 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  30.43 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.98 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  37.21 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  33.33 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  35.63 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.25 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.75 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  33.75 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  30.85 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.98 
 
 
97 aa  42  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  28.72 
 
 
109 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  34.83 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.29 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  25.88 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  30.3 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  28.89 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 
94 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>