76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0822 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  100 
 
 		 93 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  50 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  51.65 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  43.33 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.73 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  45.65 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  46.59 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.25 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  45.74 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  40 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  45.05 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  41.76 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  48 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  35.87 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  40.66 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  36.56 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  41.3 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  40.66 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.63 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  48.89 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  48.89 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  48.89 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  38.55 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  35.56 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.62 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  37.23 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  39.56 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  36.49 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  35.87 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.95 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  34.74 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  36.08 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  36.59 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  38.2 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.47 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  31.18 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.88 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  32.61 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 348 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  24.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  26.88 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.44 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  28.74 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>