67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0570 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  52.83 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  50.47 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  45.79 
 
 
109 aa  111  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  47.66 
 
 
110 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  46.73 
 
 
109 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  48.6 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  34.65 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  35.64 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  31.37 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  34.31 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  35 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  30.39 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  34.62 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  32.69 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.35 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.02 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30.3 
 
 
104 aa  52  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  34.31 
 
 
103 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  31.52 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  28.16 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  27.55 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  35.16 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  40.85 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  29.91 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  30.93 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  29.91 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  34.07 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  31.25 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  27.91 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.13 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  29 
 
 
103 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  28.87 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2342  hypothetical protein  28.83 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.441913  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  27.84 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
96 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6084  plasmid stabilization system  28.42 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  31 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
96 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.21 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.52 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  28.28 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  32.99 
 
 
101 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0241  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  30.38 
 
 
95 aa  40.8  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  27.88 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2467  plasmid stabilization system protein  25.74 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  28.87 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  38.3 
 
 
94 aa  40  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  36.17 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>