65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0757 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  203  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  96 
 
 
100 aa  193  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  84.85 
 
 
101 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  82 
 
 
100 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  81 
 
 
100 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  91.95 
 
 
87 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  76.53 
 
 
100 aa  156  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  63.27 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  60.2 
 
 
103 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  59.41 
 
 
104 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  55.56 
 
 
102 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  41.05 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  47.73 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.08 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.46 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  31.37 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  35.35 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  33 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  36.67 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  28 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  29 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.79 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 
108 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  33.66 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  31.87 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  32.61 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  32.97 
 
 
94 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
100 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 
97 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  33.73 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  39.33 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  31.18 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  30.21 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  26.47 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  36.67 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  29.79 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  26.47 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.77 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  23.96 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.43 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.35 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  37.18 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  33.33 
 
 
93 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2622  hypothetical protein  29.9 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.428303  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.06 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.73 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  34 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  32.95 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>