31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02187 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  91.95 
 
 
100 aa  163  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  90.8 
 
 
100 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  83.72 
 
 
101 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  77.01 
 
 
100 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  75.86 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  71.76 
 
 
100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  58.82 
 
 
103 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  57.14 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  55.68 
 
 
104 aa  95.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  45.88 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  48.39 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  41.03 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  40.51 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  40.28 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.53 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.95 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  28.09 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  38.71 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  31.4 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  27.91 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.88 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  33.75 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  24.72 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.37 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  34.67 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  30 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  25.58 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>