70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3300 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  79.44 
 
 
107 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.49 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.54 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  40.7 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  34.31 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.23 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.56 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  35.42 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.27 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  37.63 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0496  hypothetical protein  37.84 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.693106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  33.66 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  32.32 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  34.44 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  32.98 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  31.91 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  32.98 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  31.68 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  32.14 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  30.68 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  33.98 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  34.52 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  29.67 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  29.47 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  32.41 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  34.07 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
101 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
101 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  30.12 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2205  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.39 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000157964  hitchhiker  0.00000000176055 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  30.86 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  27.71 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  32.97 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1411  hypothetical protein  27.55 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  28.24 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  30.85 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  27.59 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4905  hypothetical protein  34.52 
 
 
89 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  29 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2622  hypothetical protein  26.32 
 
 
96 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.428303  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  26.92 
 
 
79 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  28.57 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  28.41 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  27.17 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.47 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  29.55 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  26.32 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  29.7 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  26.74 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 
95 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>