31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0922 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  100 
 
 		 98 aa  193  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  64.52 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  60.42 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  59.14 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  42.27 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  41.05 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  40.66 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  36.67 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  35.96 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 100 aa  48.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  38.71 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  37.36 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  37.68 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  31.91 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  39.06 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.81 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  38.1 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  30.95 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  24.14 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  34.67 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>