73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1668 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  100 
 
 
110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  57.41 
 
 
109 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  57.41 
 
 
108 aa  134  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  52.78 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  56.07 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  54.63 
 
 
108 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  47.66 
 
 
108 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  33.64 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.45 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  37.76 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  33.98 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  35.51 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.08 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  34 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  33 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  30.85 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  30.85 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.34 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  36.08 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  31.87 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.69 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  29.79 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  30.1 
 
 
112 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  31.11 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.13 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  30.21 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  28.26 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  32.22 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  31.68 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  28.09 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  31.52 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  29.9 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  29.63 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  26.17 
 
 
112 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  26.17 
 
 
112 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0124  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  4.16771e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  35.29 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  29.79 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0746  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  30.56 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000854899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  26.53 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2467  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  30.19 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  31.87 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  26.8 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  32.71 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0750  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2329  plasmid stabilization system  31.96 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  28 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2238  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.23 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  44.68 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.14 
 
 
93 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>