60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0677 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  54.63 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  52.78 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  52.83 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  53.7 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  52.78 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  50.94 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.45 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  39.05 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  35.92 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  38.14 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  33.65 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.73 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  31 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31.96 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  35.56 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  30.93 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  32 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  31.96 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  37.21 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  29.9 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  30.61 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  34.65 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  34.82 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  36.14 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  33.01 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.72 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  30.61 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  27.84 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.85 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  32.98 
 
 		 95 aa  43.5  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2467  plasmid stabilization system protein  32.65 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  29.35 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  32.04 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2238  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  22.33 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2329  plasmid stabilization system  31.96 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0124  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  23.08 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.16771e-22 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  32.98 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  23.16 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  32.47 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  23.16 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  26.67 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  26.67 
 
 		 112 aa  40  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>