85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6483 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  59.38 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  56.25 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  55.67 
 
 		 97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  38.95 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  41.38 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  40 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  38.89 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  34.12 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  34.12 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  34.88 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  30.93 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  31.52 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  30.93 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  33.73 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  35.37 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.94 
 
 		 99 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  35.42 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  31.18 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  28.24 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  33.73 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  35.96 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.53 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  27.84 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  33.73 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  32.26 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  28.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  28.89 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  37.63 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  36.36 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.04 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  29.35 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  28.26 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  31.87 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  34.83 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 98 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  27.66 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.11 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  30.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  32 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  28.4 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  30.93 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.07 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  28.87 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  31.37 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.71 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  28.74 
 
 		 94 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>