67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1263 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.96 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  39.77 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  37.23 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  38.64 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  34.31 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.43 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  37.63 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.61 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  39.33 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  34.69 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.35 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2205  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.02 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000157964  hitchhiker  0.00000000176055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  37.36 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  30.3 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  31.68 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.59 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.69 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  31.68 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  37.08 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  37.08 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  28.43 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  31.31 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  31.31 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  34.65 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  31.96 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.29 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  30.68 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  31.17 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.09 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  26.04 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  28 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.43 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  34.83 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  35.23 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 95 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  27.91 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2467  plasmid stabilization system protein  34.29 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  27.4 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  30.12 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  28.24 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3885  addiction module toxin, RelE/StbE family  25 
 
 		 93 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0194678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>