80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0573 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  48.31 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  46.15 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  42.7 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  43.33 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  37.65 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  37.65 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  36.36 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  38.71 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  37.65 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  37.08 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  35.16 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  37.5 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.94 
 
 		 98 aa  47.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3446  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  31.31 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  34.21 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  26.14 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  35.37 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  25.88 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  28.42 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.89 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  34.15 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  33.87 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 106 aa  43.9  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  25.3 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  25.3 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  25.3 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  28.74 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  35.09 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.79 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4905  hypothetical protein  37.66 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  26.32 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  35.8 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  40.28 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  37.93 
 
 		 97 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  24.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  24.72 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  34.57 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  36.21 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.1 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>