24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2937 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  100 
 
 
106 aa  217  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  65.05 
 
 
109 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  65.38 
 
 
111 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  63.46 
 
 
111 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  62.86 
 
 
109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  59.62 
 
 
111 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6480  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834364 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3567  plasmid stabilization system protein  40.24 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1660  hypothetical protein  37.36 
 
 
200 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.067401  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  35.29 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  35 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  31.13 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  32.32 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  28.89 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  29.13 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  29.13 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  35.8 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  25.74 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3026  plasmid stabilization system  37.25 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  28.85 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  27.38 
 
 
94 aa  40  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  25.84 
 
 
93 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>