24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5181 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  100 
 
 
101 aa  202  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5833  plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6594  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000313178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2290  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0061658  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  40.91 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5511  plasmid stabilization system  33.77 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  35.56 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1994  plasmid stabilization system  25.49 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.947377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0304  plasmid stabilization system  25.49 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0426013  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  36.14 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  36.14 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  37.65 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  34.78 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  34.09 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  35.23 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  36.63 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.17 
 
 
103 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  35.8 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>