65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2032 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  87.88 
 
 		 99 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  43.96 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  43.33 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  38.95 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  37.5 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  42.5 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  38.2 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  37.78 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  35.23 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  39.76 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  37.5 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  38.3 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.52 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  34.74 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.3 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  32.32 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  28.43 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  35.8 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  34.31 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  29.59 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  29.17 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  37.14 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  30.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  37.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  33 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2345  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.958194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  30.12 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  27.72 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  28.92 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  30.68 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  26.74 
 
 		 103 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  30.38 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  39.58 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>