37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0699 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  37.78 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  36.78 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  31.46 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.67 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  28.43 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.63 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  31.96 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  31.88 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  30.21 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  30.3 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  31 
 
 		 99 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  28.28 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  27.54 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>