59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0004 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 
99 aa  207  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  42.7 
 
 
97 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  41.57 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  35.42 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  37.11 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  38.2 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  35.37 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  35.16 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  43.02 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
97 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  34.44 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  35.71 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  36.47 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  32.18 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  36.47 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  31.65 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  30.93 
 
 
111 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  35.48 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 
98 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  32.97 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  35.94 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  34.09 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  36.9 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  32.05 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  30 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  32.58 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  36.62 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  26.55 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  27.38 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  29.47 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  28.38 
 
 
121 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  33.71 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>