57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0711 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 100 aa  207  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  52.58 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  53.12 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  51.09 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  48.91 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  47.83 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  37 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  41.41 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  37.89 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  37.23 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  40.21 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  35.87 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  30.3 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  31.63 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  28.28 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  28.28 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  31.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  33.04 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  28.7 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.18 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  27.84 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  28.32 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  33.66 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  27.66 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  25.51 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.59 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  30.1 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  35.23 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  26.6 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  31.76 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  25.56 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  25.53 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>