19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3497 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  97.06 
 
 		 102 aa  203  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  86.27 
 
 		 102 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  78 
 
 		 103 aa  167  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  60.4 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  31.82 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.58 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  28 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  33.73 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  30.26 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  36.73 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  24.47 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  28.95 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  28.95 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  30.1 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  26.88 
 
 		 103 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>