59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2911 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  40.86 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  41.84 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  37.37 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  36.17 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  37.25 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  37.36 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  32.65 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  34.69 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  29.59 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  31.37 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  32.32 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  30 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  28.43 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  29.79 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  32.88 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  27.55 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  32.1 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  27.91 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  28.16 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  29 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.69 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.69 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  30.3 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.63 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  46.34 
 
 		 103 aa  43.9  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  28.89 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  32.46 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  29.29 
 
 		 97 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  24 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  24.47 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.77 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.77 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  31.51 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>