18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06885 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  30.23 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  27.91 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  30.59 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  25.29 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  26.51 
 
 		 100 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  27.91 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  27.91 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  25.88 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  27.03 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>