64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1517 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  96.88 
 
 		 96 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  57.29 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  53.26 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  47.83 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  41.3 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  47.87 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  43.48 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  46.39 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  41.3 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  36.17 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  41.76 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  40.66 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  33.68 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  37.5 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  38.54 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  37.89 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  32.22 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  35.63 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  37.35 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  35.48 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  38.64 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  32.97 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  30 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  28.26 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  26.6 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  29.36 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  37.5 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  32.65 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  29.03 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 93 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  36.17 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  30.1 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  26.74 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 98 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>