30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5297 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  100 
 
 		 97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  73.4 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  68.42 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  48.65 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  40.86 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  46.67 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.56 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  33.75 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  29.73 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  36.47 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  31.52 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  31.46 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  25.93 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  36.21 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 		 96 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  28.24 
 
 		 94 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>