34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7135 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  73.4 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  67.02 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  47.87 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  50.6 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  48.57 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.18 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  38.2 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.96 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  33.71 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 97 aa  47.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  31.65 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  33.72 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  25.29 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  25.29 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  25.29 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  25.29 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  28 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  35.94 
 
 		 90 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>