21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1148 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  183  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  44.62 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.94 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  40.85 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  39.44 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  37.1 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  32.05 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  37.14 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  34.25 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  35.71 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  34.43 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  34.38 
 
 		 99 aa  42  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  39.44 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  35.19 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  30.3 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  35.94 
 
 		 97 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 114 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>