65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3750 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 102 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  53.01 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  50.6 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  46.67 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  37.11 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  34 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  37.18 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  46.88 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  29.67 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  34.62 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  35 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  36.26 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  37.35 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  36.25 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.4 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.99 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.58 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  27.37 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  28.72 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  27.91 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  35.9 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.86 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  32.53 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  25.29 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  39.44 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 98 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.86 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  28.05 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  28.05 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  28.05 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  28.05 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  25.88 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.27 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  24.74 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  24.74 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>