57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5431 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  100 
 
 		 96 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  38.2 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  36.05 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  37.18 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  30.34 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  44.62 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  36.47 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  34.88 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  30.23 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  30.23 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  32.53 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  32.18 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  34.88 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  26.97 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  33.75 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  23.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  27.59 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  31.82 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  23.6 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  30.12 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  34.48 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  28.92 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  27.71 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  28.85 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  23.6 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  27.71 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  24.42 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  28.57 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  25.56 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>