62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0123 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  100 
 
 		 97 aa  200  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  98.97 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  57.89 
 
 		 99 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  51.06 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  51.06 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  35.48 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  37.63 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  40.91 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  36.78 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  37.63 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  39.33 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  34.83 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  32.93 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  36.36 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  32.58 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  33.71 
 
 		 99 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  32.1 
 
 		 102 aa  47.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  39.44 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  31.18 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  27.17 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  30.12 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.82 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  23.91 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 98 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  27.91 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  30.38 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  28.28 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>