35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2490 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  100 
 
 
111 aa  224  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  79.28 
 
 
111 aa  182  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  34.41 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  32.26 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  31.18 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  35.71 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  36.47 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  28 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.65 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  34.25 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  30.85 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  29.79 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  37.1 
 
 
90 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
96 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  27.08 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  34.12 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  37.66 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  26.73 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  26.73 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  26.73 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  26.73 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  34.88 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>