51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0079 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  207  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  58.95 
 
 		 97 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  57.89 
 
 		 97 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  44.68 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  44.68 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  37.11 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.48 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  35.96 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  32.98 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  33.33 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  30.23 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  26.83 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  27.59 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  29.47 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  32.95 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  30.11 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  30.34 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  29.21 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  32.56 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 99 aa  43.9  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  25.81 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  34.38 
 
 		 90 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  22.34 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  23.96 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  25.53 
 
 		 100 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>