49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2644 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  100 
 
 		 100 aa  207  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  43.18 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  41.3 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  42.22 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  41.76 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  37.08 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  38.95 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  37.5 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  38.14 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  36.36 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  35.96 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  31.52 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  29.35 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  36.9 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  29.79 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  32.95 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  32.94 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  35.53 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  34.48 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  26.51 
 
 		 95 aa  42  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  39.29 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  31.82 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  39.58 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  26.74 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  31.82 
 
 		 100 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>