45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3831 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  45.36 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  45.12 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  46.74 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  43.48 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  41.24 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  40.43 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  39.36 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  40.62 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  38.3 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  40.62 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  38.3 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  37 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  38.54 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  34.04 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.95 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  34.88 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.21 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  28.41 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.21 
 
 		 98 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  30.77 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>