55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2585 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  100 
 
 
100 aa  210  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  56.99 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  46.81 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  45.74 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  41.05 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  41.41 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  42.39 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  37 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  41.24 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  41.24 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  38.71 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  37.5 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  40.43 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  37.25 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  35 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.18 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  30.93 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  28.07 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  36 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  34.09 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34.34 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  32.99 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  26.09 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  31.46 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  29.59 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  30.34 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  26.5 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  34.12 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  32.65 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  33.7 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  27.55 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  34.72 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  35.05 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  25.29 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  31.11 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 
102 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  32.63 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>