58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2504 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  47.96 
 
 
99 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  36.26 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  34.38 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  35.16 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  30.53 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  34.15 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  35.79 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.37 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  36.59 
 
 
86 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  29.67 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  28.42 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  36.14 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.27 
 
 
107 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  25 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  29.03 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  28.87 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3446  plasmid stabilization system  35.48 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.85 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  30.43 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  27.66 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  29.03 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  28.85 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  27.66 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  34.15 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  26.8 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  26.6 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  30.85 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  28.87 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2885  plasmid stabilization system protein  27.72 
 
 
105 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  28.12 
 
 
103 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.59 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  23.16 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  25.84 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  25.24 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  28.24 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  24.74 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  30.14 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  31.58 
 
 
104 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  34.18 
 
 
98 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>