74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4398 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 94 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  64.52 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  47.83 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.95 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  37.78 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  37.36 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  41.11 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  35.63 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  46.38 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  32.97 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  34.21 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  35 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  36.9 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  39.24 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  39.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  37.8 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  30.77 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  31.91 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  43.9 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  40.45 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.78 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.98 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  39.02 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  36.14 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.73 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  39.06 
 
 		 348 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  36.49 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  33.33 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  26.21 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  30.93 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  35.37 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  31.91 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  34.07 
 
 		 93 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  37.36 
 
 		 99 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.72 
 
 		 102 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  32.1 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  34.88 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.71 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  30.68 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>