46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1987 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  100 
 
 		 103 aa  210  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  93.2 
 
 		 103 aa  197  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  57.89 
 
 		 97 aa  115  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  55.21 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  41.76 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  36.84 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  42 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  36.67 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  38.89 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  31.68 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  33.68 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  36.17 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.41 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.02 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  30.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.87 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4905  hypothetical protein  30.34 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  30 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  32.18 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  27.55 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  31.58 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.48 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  32.91 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  31.07 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>