78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4958 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.22 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  50 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  48.91 
 
 		 98 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  43.33 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.89 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  48.86 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  42.22 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  47.19 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  43.33 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.96 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  44.44 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  43.33 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.44 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.44 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  42.22 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.44 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  43.18 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.33 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  40.66 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  43.02 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  42.39 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  47.83 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  38.89 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  45.65 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  45.65 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  45.95 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  34.07 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  36.78 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  35.56 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  39.53 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  38.46 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  39.18 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  36.49 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  36.99 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  36.99 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.54 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.01 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  35.63 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  35.87 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  34.67 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  36.96 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.11 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  45.65 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  32.61 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  32.22 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  29.35 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.84 
 
 		 348 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  36.11 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 103 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 92 aa  40  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>