32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_53 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  100 
 
 
92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  64.13 
 
 
93 aa  126  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  32.58 
 
 
96 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  24.72 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  28.74 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  24.72 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  24.72 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  24.72 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.18 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  28.26 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  29.89 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  25.56 
 
 
94 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  30.68 
 
 
94 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  28.89 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  33.33 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  26.44 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  26.37 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  25.29 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  30.77 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  30.43 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  23.33 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  29.47 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  22.73 
 
 
101 aa  43.9  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  25.84 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  29.55 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  28.89 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  28.74 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  28.57 
 
 
90 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>