63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0195 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
91 aa  184  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  52.75 
 
 
98 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  47.13 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  48.35 
 
 
99 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  36.78 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  43.82 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  40.45 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  42.22 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  39.13 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  37.5 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  34.44 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  35.87 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  40 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  39.19 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  39.36 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  39.36 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.78 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  37.78 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.16 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  38.3 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  46.88 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  37.33 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  30.68 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  31.4 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  30.86 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.56 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.5 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  31.4 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  35.63 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.83 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  34.83 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  32.58 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  29.67 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  30.14 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  34.44 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  26.97 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.11 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  23.33 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  35.82 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.41 
 
 
103 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  30.95 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  25.26 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.55 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  32.97 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.89 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>