16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4386 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  35.35 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  35.82 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.86 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  32.39 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40.35 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  37.14 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  32.88 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  36.36 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.29 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  38.78 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.21 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.73 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>