84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3843 on replicon NC_008608
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  100 
 
 
93 aa  186  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  54.35 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  54.35 
 
 
94 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  48.89 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  51.69 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  47.78 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  50.56 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  50 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  40.91 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  50.55 
 
 
99 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  47.87 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.35 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  40.7 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.22 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.48 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.18 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  47.37 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  44.94 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  44.94 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.13 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  41.57 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  41.11 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.38 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.38 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.38 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  41.38 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  42.7 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  42.17 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  39.56 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  35.63 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.53 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  43.82 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  49.25 
 
 
348 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  40.45 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  45.21 
 
 
79 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  44.62 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  39.56 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  39.08 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  39.56 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  35.63 
 
 
90 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  38.46 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  36.67 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  45.21 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  41.57 
 
 
89 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  42.86 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  42.7 
 
 
94 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  34.04 
 
 
98 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  36.9 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  36.9 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.63 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  37.21 
 
 
102 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.12 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  37.78 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.76 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.14 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  43.48 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  36.71 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  34.94 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2376  hypothetical protein  37.97 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.83 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  32.14 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  31.17 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.51 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  38.2 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>