63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0140 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  100 
 
 
94 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  88.3 
 
 
94 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  88.3 
 
 
94 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  69.15 
 
 
95 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  51.09 
 
 
98 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  47.83 
 
 
90 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  52.17 
 
 
91 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  47.83 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  51.11 
 
 
93 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  51.09 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  48.35 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  44.57 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  51.11 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  46.59 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  44.57 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  51.95 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  43.48 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  41.49 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.83 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.59 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  40.86 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  46.15 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  38.71 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  38.3 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  43.01 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  38.64 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  40.86 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  39.78 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  39.29 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  36.96 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  38.3 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  43.02 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  43.42 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  41.76 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  35.48 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  34.41 
 
 
94 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
99 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.78 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  41.38 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  41.38 
 
 
94 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  38.04 
 
 
98 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 
99 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 
92 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
95 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 
100 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
92 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 
103 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  23.33 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.42 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  34.67 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  45.16 
 
 
348 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>