54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0264 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  78.35 
 
 		 99 aa  158  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  52.75 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  45.05 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  41.49 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  63.08 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  45.65 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  44.57 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  43.82 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  36.78 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  39.13 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  39.08 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  36.96 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  43.01 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  34.04 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  34.07 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  34.04 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  37.23 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  36 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  38.71 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  38.71 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  29.21 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  32.61 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.08 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  30.26 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  26.37 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  32.97 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  26.14 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  28.74 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.98 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  28.28 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  37.63 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3885  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.59 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0194678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  34.18 
 
 		 101 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  34.18 
 
 		 101 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>