38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02178 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  64.13 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.68 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  31.46 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  30.34 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  28.26 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  34.48 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  30.34 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  31.82 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  31.03 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  32.58 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  26.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.22 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  32.63 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  24.24 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  25 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.11 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  25.84 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  26.14 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  30 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  28.09 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  31.03 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  28.89 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  28.41 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  31.82 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>