104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3558 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  50 
 
 
94 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  50 
 
 
94 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  54.35 
 
 
93 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  49.45 
 
 
94 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  51.06 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  51.65 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  45.16 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.62 
 
 
96 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  42.55 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  48.42 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.49 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  44.16 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.62 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  41.94 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  38.04 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  43.82 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  43.33 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  40.86 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  38.71 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.83 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  40.48 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  39.56 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.89 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  44 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  42.22 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  36.26 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  48.65 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.78 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  44 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  46.27 
 
 
348 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  36.26 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  36.56 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  37.23 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  36.26 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.16 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  39.36 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  38.89 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  37.63 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  39.78 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  37.23 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  43.48 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  37.63 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  37.63 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  34.44 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 
103 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 
109 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.16 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  32.97 
 
 
100 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  35.48 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  28.74 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  35.23 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  26.97 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  31.4 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  32.22 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.59 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.55 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 
92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  28.95 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 
100 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  30.85 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>