39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0980 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  78.95 
 
 		 96 aa  153  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  75.79 
 
 		 96 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  76.67 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  74.42 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  73.49 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  39.78 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  39.78 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  35.48 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  36.56 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  33.7 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  37.63 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  39.36 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 86 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  41.82 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.47 
 
 		 101 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>