92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3677 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  49.45 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  45.74 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  46.15 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  44.68 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  48.35 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.43 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  40.7 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  37.08 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  40.23 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  41.94 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.45 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  41.94 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.12 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  32.26 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  35.71 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  44.26 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  37.23 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  35.87 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  31.87 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  34.78 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.27 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  38.04 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  35 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  42.03 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  34.44 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  34.09 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  34.88 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  31.52 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  35.11 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  35.87 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  30.11 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  29.67 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  41.38 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  30.43 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0407  hypothetical protein  31.31 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  27.47 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  29.21 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0416  hypothetical protein  31.31 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  37.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  30.95 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  30.23 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  30.23 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  34.25 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  30.43 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.44 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  26.67 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  30.59 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  34.02 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 		 99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  26.88 
 
 		 97 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  40.82 
 
 		 100 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>