65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1024 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  100 
 
 		 97 aa  193  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  63.83 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  44.09 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  39.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  36.84 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.7 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  42.22 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  37.78 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  35.79 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  37.63 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  40.91 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.68 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  36.96 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  35.16 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  37.62 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  37.21 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  38.3 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  36.26 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  28.42 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  28.42 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  33.67 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  29.47 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  36.59 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  26.8 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  38.2 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  35.8 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  36.46 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  31.11 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.05 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  33.7 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  26.88 
 
 		 96 aa  43.5  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  30.43 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  35.23 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  26.74 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  29.47 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>