45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0593 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  100 
 
 		 98 aa  197  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  48.31 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  43.96 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  43.96 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  33.73 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  34.15 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  34.15 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  40.91 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.75 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  32.98 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.96 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  28.12 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  30.3 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  29.17 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  36.36 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.88 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  35.23 
 
 		 91 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 		 94 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  35.06 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  28.12 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3446  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>