76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1299 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  87.88 
 
 		 99 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  43.33 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  43.96 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  39.77 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  41.11 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  38.2 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  38.3 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  36.84 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  42.5 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  36.67 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  41.25 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  38.55 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  40.26 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  37.37 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2345  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.958194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  30.43 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  37.66 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  30.77 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  26.8 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  27.55 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  37.65 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  35.48 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  27.55 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  27.91 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.78 
 
 		 103 aa  43.9  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  34.78 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  30 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  32.58 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  36.59 
 
 		 97 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  31.87 
 
 		 91 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3446  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  27.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  25.53 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03820  Plasmid stabilisation system protein  26.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  28.74 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  26.74 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.47 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 98 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 106 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 96 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>